כולל תורת יוסף מכשיר רבנים ומחנכים בתכנית חמש-שנתית הכוללת לימודי הלכה ובסופה בחינות הסמכה של הרבנות הראשית. עשרים תלמידי הכולל ובני משפחותיהם מתגוררים בישיבה, ולומדים תכנים הלכתיים וחברתיים בתכנית מגוונת ומקיפה, ובנוסף מעמיקים בתכני סוגיות העולות בעת הנהגת קהילה.
לאחר בחינות ההסמכה לרבנות, בוגרי הכולל מכהנים כרבני קהילה ומחנכים בישראל ומיישמים באופן מיטבי את שלמדו בלימודיהם.
